Su construcción tomo 150 años y es la obra más grande de todos los centros históricos de América. Fue iniciada en 1550 y finalizo en 1680. A diferencia de la compañía, San Francisco fue la casa de los franciscanos. La obra fue modificada varias veces debido a todos los terremotos que se dieron en la ciudad y que derribaron a la iglesia.
El estilo de su arquitectura y escultura es el manierismo y el barroco, el manierismo es un estilo que se da por primera vez en esta iglesia lo que causa un gran impacto en el arte en toda América. Su interior es hecho de pan de oro y en el altar mayor se encuentra la Virgen de Quito o Virgen de Legarda, la obra más representativa de la ciudad.
La iglesia también es conocida por su famosa leyenda; "La Leyenda de Catuña", la misma que es conocida por todos los quiteños.






